Зимой 1996 года в районе границы Чечни с Ингушетией вместе с
тремя сослуживцами (Александром Железновым, Андреем Трусовым, Игорем
Яковлевым) попал в плен к боевикам.
Находился в плену в селе Бамут в течение ста дней, на протяжении которых подвергался избиениям и пыткам.
В день своего рождения, в праздник Вознесения, вместе с тремя пленными
товарищами был выведен в лес. Всем четверым было предложено перейти в
ислам и присоединиться к банде.
Имеющему нательный крестик Родионову было предложено сорвать с себя
символ Христа и тем самым сохранить себе жизнь. После отказа два
пленника были убиты выстрелами в темя, Евгению и еще одному солдату
боевики перерезали горло, а затем отрезали головы.